《國家稅務(wù)總局關(guān)于未按期申報(bào)抵扣增值稅扣稅憑證有關(guān)問題的公告》(國家稅務(wù)總局公告2011年第78號)規(guī)定，增值稅一般納稅人取得的增值稅扣稅憑證已認(rèn)證或已采集上報(bào)信息、但未按照規(guī)定期限申報(bào)抵扣;實(shí)行納稅輔導(dǎo)期管理的增值稅一般納稅人、以及實(shí)行海關(guān)進(jìn)口增值稅專用繳款書“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人，取得的增值稅扣稅憑證稽核比對結(jié)果相符但未按規(guī)定期限申報(bào)抵扣，屬于發(fā)生真實(shí)交易且符合本公告第二條規(guī)定的客觀原因的，經(jīng)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)審核，允許納稅人繼續(xù)申報(bào)抵扣其進(jìn)項(xiàng)稅額。

該公告中“主管稅務(wù)機(jī)關(guān)”指的是縣級稅務(wù)局還是基層稅務(wù)分局(所)?其實(shí)，稅收政策文件中“主管稅務(wù)機(jī)關(guān)”、“征收機(jī)關(guān)”指縣級以上稅務(wù)局，且早有明確規(guī)定。

政策依據(jù)：《國家稅務(wù)總局關(guān)于明確流轉(zhuǎn)稅、資源稅法規(guī)中“主管稅務(wù)機(jī)關(guān)、征收機(jī)關(guān)”名稱問題的通知》(國稅發(fā)〔1994〕232號)規(guī)定，在增值稅、消費(fèi)稅、營業(yè)稅、資源稅暫行條例、實(shí)施細(xì)則及相關(guān)文件中，對“主管稅務(wù)機(jī)關(guān)”、“征收機(jī)關(guān)”已作了解釋，但是，由于各地國家稅務(wù)局和地方稅務(wù)局機(jī)構(gòu)的分設(shè)，原名稱所指已發(fā)生變化，現(xiàn)重新明確如下：

《中華人民共和國增值稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》第三十六條第二款中所稱“主管稅務(wù)機(jī)關(guān)、征收機(jī)關(guān)”，指國家稅務(wù)總局所屬的縣級以上國家稅務(wù)局，第二十八條、第三十二條第四款中所稱“國家稅務(wù)總局直屬分局”，指省、自治區(qū)、直轄市國家稅務(wù)局，也包括享有省級經(jīng)濟(jì)管理權(quán)限城市的國家稅務(wù)局。

《中華人民共和國消費(fèi)稅暫行條例》第十三條、《中華人民共和國消費(fèi)稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》第十八條、第二十三條、第二十四條、《消費(fèi)稅若干具體問題的規(guī)定》第三條、第五條中的“主管稅務(wù)機(jī)關(guān)”，指國家稅務(wù)總局所屬的縣級以上國家稅務(wù)局。《中華人民共和國消費(fèi)稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》第二十一條、第二十五條、《消費(fèi)稅若干具體問題的規(guī)定》第四條中“國家稅務(wù)總局所屬稅務(wù)分局”，指省、自治區(qū)、直轄市國家稅務(wù)局，也包括享有省級經(jīng)濟(jì)管理權(quán)限城市的國家稅務(wù)局。

《中華人民共和國營業(yè)稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》第五條、第六條中所稱“國家稅務(wù)總局所屬征收機(jī)關(guān)”，指國家稅務(wù)總局所屬的縣級以上國家稅務(wù)局。

《中華人民共和國資源稅暫行條例》第十二條中的“省、自治區(qū)、直轄市稅務(wù)機(jī)關(guān)”，指省、自治區(qū)、直轄市地方稅務(wù)局和享有省級經(jīng)濟(jì)管理權(quán)限城市的地方稅務(wù)局。《中華人民共和國資源稅暫行條例》第十二、十三條以及《中華人民共和國資源稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》第五條、第八條、第九條、第十條所說的“主管稅務(wù)機(jī)關(guān)”或“稅務(wù)機(jī)關(guān)”，指縣級以上的地方稅務(wù)局。